124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0613 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  87.56 
 
 		 225 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  86.46 
 
 		 229 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  78.18 
 
 		 240 aa  329  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  77.57 
 
 		 223 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  77.57 
 
 		 225 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  75.12 
 
 		 225 aa  318  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  79.44 
 
 		 237 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  79.44 
 
 		 237 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  74.65 
 
 		 224 aa  317  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  75.12 
 
 		 225 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  75.12 
 
 		 225 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  74.54 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  74.54 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  74.54 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  74.65 
 
 		 225 aa  314  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  78.54 
 
 		 221 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  79.44 
 
 		 222 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  51.39 
 
 		 214 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  49.29 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  48.36 
 
 		 217 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.52 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.37 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.6 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.79 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.64 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  27.23 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  27.23 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  22.27 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  22.27 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  26.76 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  26.76 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.01 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.76 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.76 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.08 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  24.29 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  31.79 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.66 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  23.49 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  23.49 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.12 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  30.06 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  23.12 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  23.12 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  28.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.17 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  23.12 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  23.12 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  32.14 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  32.14 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.87 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.63 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  30.12 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  23.12 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  23.12 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.07 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.37 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  31.3 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  31.3 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  31.3 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  31.3 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  31.3 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  26.96 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  30.63 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  32.43 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  30.3 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  32.14 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  31.25 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  26.47 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.62 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.33 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>