85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3289 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 223 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.72 
 
 		 223 aa  317  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.92 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.47 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  47.2 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  44.86 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  44.86 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  44.86 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  44.86 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  44.86 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  44.86 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  44.86 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  44.86 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  45.33 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  44.39 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  44.39 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  43.46 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  42.72 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  49.3 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  48.39 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.66 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  38.57 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  25.48 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  30.67 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  25.45 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  30.18 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  27.32 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  25.4 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  25.4 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  25.46 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  25.24 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  22.86 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  22.58 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  23 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  22.82 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  22.82 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  22.82 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  22.82 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  22.82 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  22.58 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  22.82 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  30.28 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  25.46 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  29.36 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  28.49 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  28.49 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  25.82 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.24 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  26.15 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.57 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.23 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  26.17 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.09 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.42 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.42 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  23.83 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.42 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  28.57 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  24.07 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  28.24 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.06 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  27.68 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  29.29 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.69 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  27.74 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  26.48 
 
 		 206 aa  42  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 		 204 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  26.88 
 
 		 205 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>