267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  100 
 
 		 203 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  95.68 
 
 		 203 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0661  lysine exporter protein LysE/YggA  63.82 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  hitchhiker  0.00312579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  45.81 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  34.97 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.13 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  24.87 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  25.29 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  25.29 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  24.37 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  24.71 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.93 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  34.25 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.34 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  35.17 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  35.17 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  34.62 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  34.62 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  30.07 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  34.62 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  30.07 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.5 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  26.87 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  26.87 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  26.87 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  26.87 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  26.87 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  26.87 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  28.43 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  26.37 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  26.87 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.38 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.89 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  23.86 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.38 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  23.86 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  33.97 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  33.97 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  23.98 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  32.81 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  27.21 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.33 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  28.78 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.74 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  29.55 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  29.55 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  34.72 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  32.74 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  29.55 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  28.06 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  31.52 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  31.52 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  29.55 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.55 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.55 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  32.33 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.71 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  30.25 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  30.25 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  30.25 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  30.25 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  28.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  30.25 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  30.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  30.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.08 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.56 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  32.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  30.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  35.04 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  30.86 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  30.86 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  32.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  32.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  30.86 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  32.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  30.86 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  32.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>