100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0867 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  94.27 
 
 		 227 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.04 
 
 		 223 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.22 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  43.72 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  44.86 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  42.52 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  43.46 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  43.46 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  43.52 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  43.52 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  43.46 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  43.46 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  43.46 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  42.99 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  43.46 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  42.99 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  42.99 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  40.47 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  41.59 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  41.51 
 
 		 220 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  44.55 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  39.72 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  38.86 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  42.99 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.53 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  29.51 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  22.27 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  22.27 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.12 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  22.94 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  24.41 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  24.41 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  27.31 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  24.41 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  25.38 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  23.94 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  23.94 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  24.41 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.94 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  23.94 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  23.4 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  23.4 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  23.4 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  23.94 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.05 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  23.4 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  23.4 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  23.4 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  23.44 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  27.64 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  25.45 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  27.64 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  27.6 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  25.6 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  25.26 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  25.26 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  28.35 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.07 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  25 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.97 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  24.38 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  26.94 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  28.15 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.8 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.48 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  24.79 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  25.62 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  32.1 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  32.1 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  27.22 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  27.22 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.56 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0661  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  hitchhiker  0.00312579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  32.1 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  30.85 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.66 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.15 
 
 		 205 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  30 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  28.38 
 
 		 210 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  30.86 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  30.86 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  30.86 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  30.86 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  30.86 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  30.86 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.58 
 
 		 186 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>