73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2176 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.14 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  42.27 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1371  lysine exporter protein LysE/YggA  39.6 
 
 		 206 aa  99  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.51 
 
 		 226 aa  98.6  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.96 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  31.21 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  31.55 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  32.05 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  27.09 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  27.89 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  27.89 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  27.88 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  27.83 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  30.16 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  27.83 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  30.16 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  30.16 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  30.95 
 
 		 247 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  27.83 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  25.47 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  30.16 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  28.36 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  28.36 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  27.54 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  27.54 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  30.25 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  24.44 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  30.51 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  30.51 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  24.69 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  25.41 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.23 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  24.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  24.69 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  28.5 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.06 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  27.04 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  27.37 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  22.78 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.49 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  25.12 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  25.12 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  25.12 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  25.12 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  25.37 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.42 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  25.12 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  25.49 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  25.49 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  25.98 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  25.12 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  24.88 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4097  lysine exporter protein LysE/YggA  24.51 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  25.12 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  27.09 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 		 225 aa  42  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.75 
 
 		 209 aa  42  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.23 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  24.14 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>