112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4097 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4097  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2720  hypothetical protein  39.89 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  25.95 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  26.34 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  27.89 
 
 
640 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.32 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.32 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
209 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  28.11 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  26.74 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  26.56 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  26.59 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  27.47 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  26.34 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  27.27 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  28.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  26.46 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  28.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  28.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  28.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  28.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  28.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  29.1 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  28.5 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  26.7 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  25.79 
 
 
207 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.43 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  26.6 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  26.6 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  26.6 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  26.92 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.24 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  26.6 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  28.19 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  27.81 
 
 
198 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.9 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
195 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  25.71 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  24.28 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.9 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  24.32 
 
 
174 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  22.68 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2299  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
206 aa  45.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.691997  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  26.56 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  26.49 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0441  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.18 
 
 
206 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 
197 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  25.39 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  26.67 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  27.41 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  26.82 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  31.82 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  31.13 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  26.82 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.04 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.26 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  28.88 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.1 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  26.26 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  26.26 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  26.26 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  26.26 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  26.26 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  24.51 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  34.71 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  34.71 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  34.71 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  34.71 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2973  neutral amino-acid efflux protein  28.42 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  24.61 
 
 
204 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2463  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  26.74 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  30.19 
 
 
200 aa  42  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2857  neutral amino-acid efflux protein  28.42 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.719199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2861  neutral amino-acid efflux protein  28.42 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2839  neutral amino-acid efflux protein  28.42 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>