27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3303 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3303  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 237 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  hitchhiker  0.000332886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  83.56 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  47.98 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.19 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.83 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.215816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  30.16 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.21 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.69 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  28.8 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  31.09 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  25.6 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>