29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3076 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 225 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3303  lysine exporter protein LysE/YggA  83.56 
 
 		 237 aa  228  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  hitchhiker  0.000332886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  48.21 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.64 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.86 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.215816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  30.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.97 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  27.89 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  27.51 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  28.27 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  29.46 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  31.18 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  34.42 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.11 
 
 		 213 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  25.91 
 
 		 212 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>