22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3468 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
218 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.215816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  46.08 
 
 
202 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.72 
 
 
209 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3303  lysine exporter protein LysE/YggA  44.93 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  hitchhiker  0.000332886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  43.38 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.96 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  27.14 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  27.34 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  25.15 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  26.35 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4707  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
196 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  normal  0.57168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 
240 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>