186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3067 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
198 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.55 
 
 
205 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.01 
 
 
205 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  38.07 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.12 
 
 
207 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.12 
 
 
191 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.19 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  35.17 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  33.75 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  25.51 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  27.94 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  26.87 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.9 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.75 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.35 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  30.34 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.45 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.87 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1426  LysE family protein  35.96 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  27.09 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  25.24 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  26.09 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  30.91 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  26.09 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  26.09 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  26.09 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.31 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 
242 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  29.7 
 
 
220 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.81 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.81 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.09 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  26.09 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.37 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  30.58 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.22 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1186  putative lysine exporter protein  29.82 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
213 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  31.58 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
216 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.06 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  30.5 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.4 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  25.15 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  23.08 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  32.26 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.85 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  25.73 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3139  LysE family translocator protein  33.04 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3176  LysE family translocator protein  33.04 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  30.3 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  24.42 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2021  LysE family protein  33.04 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  24.42 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  24.42 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.31 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  24.42 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.32 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0893  LysE family protein  33.04 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2726  LysE family protein  33.04 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726178  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1883  LysE family protein  33.04 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  23.86 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  27.4 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.36 
 
 
211 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  27.4 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  23 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.7 
 
 
223 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.15 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.15 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  26.09 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  27.15 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  27.15 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>