More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3139 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3176  LysE family translocator protein  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3139  LysE family translocator protein  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2021  LysE family protein  99.03 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2726  LysE family protein  99.03 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3193  amino acid transporter LysE  99.03 
 
 
304 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0893  LysE family protein  99.03 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1883  LysE family protein  99.03 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1426  LysE family protein  94.2 
 
 
204 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.03 
 
 
204 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
204 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
204 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
204 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.52 
 
 
204 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.52 
 
 
204 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
204 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.52 
 
 
204 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  37.67 
 
 
194 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  37.67 
 
 
194 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  37.67 
 
 
194 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  37.67 
 
 
194 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
227 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.32 
 
 
216 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.33 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 
208 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.96 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.5 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  36.3 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  35.5 
 
 
208 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.67 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.88 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.9 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.54 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.33 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  33.73 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  33.33 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  37.58 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  37.58 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  33.73 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  38.96 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  37.58 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  33.58 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  33.73 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.14 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.69 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.13 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  33.97 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  35.66 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.31 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.57 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.8 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.19 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  31.63 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.52 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2352  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.06 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  28.23 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  32.26 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  36.03 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.8 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.1 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  36.23 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  32.41 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  31.11 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.8 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2171  amino acid transporter LysE  28.49 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228082  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  36.07 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>