58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5675 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
212 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.920689  normal  0.0700576 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  23.94 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  26.53 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.77 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  26.7 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  27.87 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
240 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  26.23 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.74 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  25.95 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  25.95 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  25.95 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  25.95 
 
 
224 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  24.86 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.26 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  25.13 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  25.41 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  21.43 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  20.92 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.01 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  20.92 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  21.43 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  27.94 
 
 
213 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.79 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  21.43 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  21.43 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  26.74 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  24.86 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  21.18 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  25.27 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  27.83 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  26.23 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  20.69 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.04 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.6 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  24.46 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  20.69 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  20.69 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  22.62 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  27.43 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  20.69 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  20.69 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  20.87 
 
 
233 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  20.69 
 
 
210 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  24.57 
 
 
220 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.82 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>