104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4081 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1646  NLP/P60 protein  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4081  NLP/P60 protein  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0487119  normal  0.0206777 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  32.59 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  37.59 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.06 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  31.45 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2488  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 314 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  23.44 
 
 		 156 aa  50.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 335 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  30.58 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  24.26 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  33.33 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  27.01 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 368 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  28.69 
 
 		 345 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  29.01 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.64 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  24.43 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  27.07 
 
 		 257 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  26.56 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  26.19 
 
 		 210 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 		 291 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  30.68 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  28.68 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.99 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  32.64 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  24.06 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  29.63 
 
 		 380 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  28.91 
 
 		 265 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.08 
 
 		 393 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  40.48 
 
 		 300 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.06 
 
 		 280 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0740  NLP/P60 family protein  28.1 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  28.23 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  25.93 
 
 		 301 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.15 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 246 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  27.21 
 
 		 342 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  30.88 
 
 		 286 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  27.21 
 
 		 342 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  27.21 
 
 		 342 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16250  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  25.55 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  26.55 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  31.34 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  30.58 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  27.96 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  33.08 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  29.23 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  31.53 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  27.61 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 202 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  30.37 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  44.44 
 
 		 197 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 281 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  29.09 
 
 		 333 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 274 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  26.12 
 
 		 302 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 271 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  31.9 
 
 		 242 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  32.32 
 
 		 696 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  39.53 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  40.48 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  29.79 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  29.09 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  27.21 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  28.36 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  28.19 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  35.71 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  35.71 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  28.19 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  29.22 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  28.18 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  23.02 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.01 
 
 		 372 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  51.72 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  50 
 
 		 359 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  25.74 
 
 		 346 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>