166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0918 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  100 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  59.03 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  59.31 
 
 		 148 aa  166  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  52.41 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  60.42 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.55 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.55 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.52 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.93 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.85 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  60.27 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.32 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  51.37 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.85 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  57.93 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  61.11 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  51.05 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.45 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.15 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  52.86 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.9 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  49.28 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.21 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.23 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.04 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.23 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  47.52 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  45.99 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  44.76 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  52.29 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  44.06 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  45.71 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.86 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  35.62 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  31.39 
 
 		 346 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  30.3 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  29.37 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  33.57 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  30.66 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  30.66 
 
 		 225 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  29.32 
 
 		 248 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  32.33 
 
 		 258 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  29.32 
 
 		 212 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 211 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  27.13 
 
 		 302 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  30.26 
 
 		 205 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  28.79 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  29.79 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  28.06 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  28.06 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  28.06 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  27.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  28.78 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  24 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  27.43 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  25.69 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  27.43 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  26.85 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  26.85 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  27.46 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  30.08 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 242 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 246 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  27.46 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  28.57 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  29.46 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  26.24 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 246 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  23.85 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  31.2 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  26.62 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  23.4 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  26.14 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  27.27 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  26.12 
 
 		 319 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  27.82 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  25.36 
 
 		 333 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  25.95 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  27.61 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>