64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2164 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  67.83 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  66.43 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  67.13 
 
 		 146 aa  182  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  62.5 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  59.85 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  55.47 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.37 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  52.45 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  55.47 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  53.28 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  52.17 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.82 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  52.17 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  52.17 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  46.15 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  51.45 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  52.17 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  45.45 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  56.12 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  53.96 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  48.97 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  44.06 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  45.65 
 
 		 171 aa  116  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.49 
 
 		 192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.97 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.62 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  49.28 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.92 
 
 		 194 aa  105  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  51.8 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  49.66 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  31.58 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  36.84 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  35.77 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  38.58 
 
 		 373 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  29.27 
 
 		 302 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  30.94 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  29.77 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  29.32 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  26.87 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  29.37 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  25.76 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  25.76 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  25.76 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  21.48 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  25.85 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  25.78 
 
 		 154 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>