42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4979 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  71.13 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  70.42 
 
 		 154 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  73.57 
 
 		 152 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  58.74 
 
 		 148 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.49 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  58.04 
 
 		 147 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  52.48 
 
 		 153 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.14 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  56.85 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.14 
 
 		 150 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.14 
 
 		 150 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  56.64 
 
 		 146 aa  140  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  58.33 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.45 
 
 		 147 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  60.74 
 
 		 148 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.73 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  46.98 
 
 		 145 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  48.94 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.61 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  48.23 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.97 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  56.49 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.76 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  50.89 
 
 		 122 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  47.92 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  43.54 
 
 		 146 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  40.43 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  45.59 
 
 		 148 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  44.22 
 
 		 146 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  44.22 
 
 		 146 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  42.76 
 
 		 144 aa  92  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.87 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  30.23 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  32.37 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  34.48 
 
 		 373 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  28.38 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  26.67 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>