47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1419 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  100 
 
 		 154 aa  306  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  90.91 
 
 		 154 aa  276  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  86.75 
 
 		 152 aa  237  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  71.13 
 
 		 194 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  62.84 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  65.73 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.33 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  59.86 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  59.15 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  59.15 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  56.52 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  61.33 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  53.42 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  60.28 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  61.7 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  63.43 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.85 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.33 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  63.83 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.06 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50.33 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  49.31 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  45.58 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.18 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  44.9 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  46.1 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.61 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  52.21 
 
 		 122 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  47.97 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.15 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  46.53 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.53 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  43.75 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.62 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  30.95 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  25.69 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  28.33 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  28.69 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  29.61 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  25.69 
 
 		 209 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  25.69 
 
 		 209 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  25.52 
 
 		 242 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  28.57 
 
 		 226 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  24.83 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  28.57 
 
 		 225 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>