37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5974 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  71.07 
 
 		 150 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  71.07 
 
 		 150 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  70.44 
 
 		 150 aa  210  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  69.18 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  71.07 
 
 		 150 aa  190  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  56.52 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  55.63 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.37 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.32 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  53.25 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  48.68 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.95 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.73 
 
 		 194 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.9 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  58 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.44 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  52.35 
 
 		 192 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  53.55 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  57.05 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.92 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.98 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  46.71 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  43.84 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  43.15 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  46.67 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.67 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.67 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.29 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  44 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  45.52 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  37.01 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  33.58 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  31.06 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  24.49 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>