96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0932 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  100 
 
 
171 aa  347  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.1 
 
 
192 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  47.06 
 
 
144 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.07 
 
 
145 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  50.36 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  46.32 
 
 
144 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  44.37 
 
 
153 aa  130  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  50 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.97 
 
 
194 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  46.98 
 
 
150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.92 
 
 
146 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  46.98 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  46.98 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  48.15 
 
 
147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.21 
 
 
147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  49.31 
 
 
154 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  46.31 
 
 
150 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  44.78 
 
 
145 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50.36 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  48.95 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  51.97 
 
 
148 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  45.65 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  47.45 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.45 
 
 
146 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  46.31 
 
 
150 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.55 
 
 
147 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.01 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  48.23 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  44 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  45.11 
 
 
141 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  41.48 
 
 
148 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  50.38 
 
 
150 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  49.53 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.97 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  29.77 
 
 
208 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  29.77 
 
 
208 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  29.77 
 
 
207 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  29.01 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  33.85 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  22.44 
 
 
207 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  33.33 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  23.48 
 
 
242 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  31.08 
 
 
242 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  25.17 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  23.02 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  26.72 
 
 
205 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  25.2 
 
 
154 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  25.2 
 
 
143 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  23.02 
 
 
157 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  25.2 
 
 
154 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  27.54 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1646  NLP/P60 protein  30.15 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4081  NLP/P60 protein  30.15 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0487119  normal  0.0206777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  26.17 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  26.17 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  25.19 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  23.66 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  23.2 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  22.7 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  22.7 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  27.94 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  22.7 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  25.42 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  24.43 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  22.7 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  22.7 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  26.17 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  22.7 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  22.7 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  22.7 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  22.7 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  24.39 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2488  hypothetical protein  28.67 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  25.42 
 
 
225 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  24 
 
 
174 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  29.1 
 
 
165 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  20.45 
 
 
231 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  26.17 
 
 
177 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  22.73 
 
 
242 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  23.7 
 
 
419 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  23.02 
 
 
205 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  22.54 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  22.54 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  22.73 
 
 
214 aa  40.8  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  21.21 
 
 
214 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  26.19 
 
 
240 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>