17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2488 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  299  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1646  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4081  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0487119  normal  0.0206777 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.82 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0132  NLP/P60 protein  28.18 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00548523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  32.43 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  29.46 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  28.67 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  30.66 
 
 		 385 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  29.46 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.19 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  27.93 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  29.46 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.1 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.1 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.1 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.81 
 
 		 194 aa  40  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>