54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2600 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  94.67 
 
 		 150 aa  288  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  94.67 
 
 		 150 aa  288  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  94 
 
 		 150 aa  286  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  94 
 
 		 150 aa  267  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  69.18 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  57.86 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.23 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  57.33 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.52 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  56.08 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.49 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  56.21 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  53.79 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  56 
 
 		 192 aa  150  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  51.39 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  60.29 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  58.39 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  58.14 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  57.04 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  48.53 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  47.79 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  52.17 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  47.95 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.09 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.89 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.98 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  50.72 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.14 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50.72 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50.72 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  49.28 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  52.73 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  35.57 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  31.58 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  31.62 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  32.03 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  25 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  34.35 
 
 		 327 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2488  hypothetical protein  28.19 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  26.32 
 
 		 325 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  28.37 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>