36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3057 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  100 
 
 		 152 aa  316  6e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  67.13 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  63.83 
 
 		 373 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  41.41 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  33.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  36.03 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  36.03 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  36.97 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  34.71 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  32.48 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  32.48 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  32.48 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  35.29 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  31.62 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.23 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  34.71 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  35.77 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  31.01 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  29.03 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  31.93 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  32.52 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  31.06 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  29.75 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.08 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  30.89 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  28.93 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  31.2 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  30.25 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  31.62 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.17 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  28.69 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  29.6 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  26.61 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  31.4 
 
 		 523 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  28.04 
 
 		 148 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>