139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3713 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  70 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  49.63 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  55.32 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  50 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  47.95 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  49.66 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  47.26 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  49.66 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  47.26 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.05 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  47.26 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  52.17 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.58 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  45.99 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  49.64 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  45.59 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.71 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.1 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  43.26 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  46.85 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.01 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  47.26 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  46.53 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.55 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  42.22 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  41.48 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  41.48 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45.71 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  45.59 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  45 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  45.37 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.33 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  35.94 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  28.93 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  28.67 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  32.71 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  30.91 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  28.15 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  30.89 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  25.56 
 
 		 302 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  26.36 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  37.7 
 
 		 373 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  30.91 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  27.01 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  26.36 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  26.36 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  27.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  29.23 
 
 		 211 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  25.18 
 
 		 211 aa  47  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  22.7 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  27.13 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  28.17 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  27.82 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  27.54 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  27.88 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  28.85 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 283 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  28.79 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  29.91 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 324 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  28.33 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  29.84 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  25.38 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  28.12 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  28.85 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 524 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  26.97 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  28.33 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  27.54 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  21.74 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  27.54 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  27.34 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  24.81 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  29.23 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  27.91 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>