43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1823 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  100 
 
 		 147 aa  296  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  82.86 
 
 		 148 aa  238  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  83.33 
 
 		 147 aa  223  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  81.69 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  76.19 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  78.08 
 
 		 150 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  64.54 
 
 		 146 aa  173  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  65.73 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  65 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  55.71 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  60.42 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  55.86 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  55.86 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  63.76 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  55.17 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.79 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  58.04 
 
 		 194 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.25 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  51.13 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.35 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  53.28 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  50.74 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  50 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.48 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  48.91 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.15 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.45 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.18 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.18 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  42.22 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  43.26 
 
 		 148 aa  117  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  46.38 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  56.86 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  36.36 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  29.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  29.27 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  26.15 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  26.36 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  25.18 
 
 		 226 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  24.82 
 
 		 225 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  30.53 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  28.23 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  26.13 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>