135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0794 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  52.41 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  55.32 
 
 		 148 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  55.71 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  55.71 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.23 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.52 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.52 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  53.52 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.42 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.93 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.61 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  55 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  52.48 
 
 		 194 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  53.19 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  57.36 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  56.12 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.68 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  52.82 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.86 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  44.68 
 
 		 144 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  43.97 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  44.37 
 
 		 171 aa  130  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  46.38 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  43.7 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  44.06 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  43.07 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  51.4 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  42.03 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  42.03 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  42.03 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  41.3 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.56 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  31.69 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  35.85 
 
 		 242 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  28.95 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  28.44 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 369 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  33.08 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  26.62 
 
 		 226 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  26.62 
 
 		 225 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  28.83 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  30.34 
 
 		 364 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 404 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 404 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  25.23 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  30.08 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 353 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  30.34 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  29.17 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  24.77 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.78 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  30.08 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  28.83 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  37.21 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  29.66 
 
 		 354 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  26.81 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  26.13 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 249 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  25.2 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  31.25 
 
 		 404 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  29.17 
 
 		 382 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  25.85 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  24.46 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  30.22 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  24.17 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  24.77 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  26.61 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  28.79 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 418 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  29.03 
 
 		 154 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 517 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>