55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4018 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  746    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  63.83 
 
 
152 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  63.04 
 
 
154 aa  190  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2724  putative phage associated protein  52.17 
 
 
703 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000314154  normal  0.0508963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3058  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  49.68 
 
 
711 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  33.12 
 
 
1252 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  26.97 
 
 
1201 aa  60.5  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  28.57 
 
 
1301 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  30.63 
 
 
1296 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  28.4 
 
 
734 aa  56.2  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  29.76 
 
 
1301 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  33.33 
 
 
148 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  29.76 
 
 
1300 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  29.76 
 
 
1300 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.11 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  29.76 
 
 
1300 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  32.03 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.11 
 
 
150 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.11 
 
 
150 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  31.21 
 
 
1286 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  29.87 
 
 
1301 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  30.92 
 
 
1300 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  30.87 
 
 
1483 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  31.18 
 
 
1313 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  26.21 
 
 
1111 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  30.19 
 
 
742 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  29.86 
 
 
1305 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.83 
 
 
192 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  23.53 
 
 
1206 aa  51.2  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  38.46 
 
 
146 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  26.71 
 
 
1296 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  30 
 
 
1339 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  30.22 
 
 
1279 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.33 
 
 
141 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  26.71 
 
 
1296 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.06 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  32.33 
 
 
137 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  37.3 
 
 
148 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  31.62 
 
 
145 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  36 
 
 
1076 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  28.65 
 
 
1297 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  31.33 
 
 
1117 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  34.15 
 
 
147 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  27.44 
 
 
1283 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  29.03 
 
 
1287 aa  46.6  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  33.85 
 
 
150 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  34.43 
 
 
144 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.48 
 
 
194 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  28.65 
 
 
1290 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  34.43 
 
 
144 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.33 
 
 
146 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  30.91 
 
 
148 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  32.32 
 
 
122 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  28.03 
 
 
1302 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  27.78 
 
 
1297 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>