56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1693 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  90.91 
 
 		 154 aa  276  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  84 
 
 		 152 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  70.42 
 
 		 194 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  63.57 
 
 		 148 aa  166  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  65 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  62.68 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.93 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.75 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  56.21 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.04 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  57.04 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.37 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  59.29 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  60.56 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  61.65 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.05 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  63.38 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  56.21 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  52.9 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  47.86 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  44.83 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  44.14 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  46.85 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  48.97 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  45.14 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  48.61 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  50.43 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  46.53 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  46.53 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  45.45 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  43.75 
 
 		 144 aa  97.1  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.23 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  29.08 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  30.71 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  25.48 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  29.93 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  25.55 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  24.26 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  24.26 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  24.26 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  27.91 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  24.79 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  24.79 
 
 		 177 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  24.39 
 
 		 177 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  31.36 
 
 		 373 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  27.19 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  26.71 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  26.67 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  32.03 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  25.55 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  25.55 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  23.97 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>