More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0132 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0132  NLP/P60 protein  100 
 
 		 175 aa  356  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00548523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1194  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.04 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  33.93 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  33.93 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.02 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  37.23 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  37.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  35.56 
 
 		 300 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  37.35 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  34.91 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.36 
 
 		 1048 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  39.76 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  34.02 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  34.02 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  34.02 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  34.02 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  33 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  34.02 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  32.43 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  34.41 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  36.67 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.35 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  32.35 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.5 
 
 		 337 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  32.22 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  32.22 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  27.1 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  29.31 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  32.23 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.22 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  31.78 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  32.97 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.63 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  31.91 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  30.4 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  35.63 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  33.68 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.47 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.9 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  36.78 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  40 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  32.53 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  32.53 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  29.81 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  30.19 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  29.84 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 308 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  32.04 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.14 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  35.79 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 385 aa  54.3  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  37.35 
 
 		 116 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  28.57 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  37.65 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  28.07 
 
 		 378 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.71 
 
 		 292 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  35.23 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  30 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  31.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  36.05 
 
 		 404 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  33.33 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  28.83 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  36.05 
 
 		 418 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  32.97 
 
 		 324 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  33.67 
 
 		 327 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  30.19 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  33.58 
 
 		 366 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>