More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16250 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16250  NLP/P60 protein  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  31.11 
 
 
333 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  32.12 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  30.95 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  28.68 
 
 
207 aa  67  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  32.03 
 
 
179 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  30 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  30.4 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  27.91 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  31.01 
 
 
211 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  28.37 
 
 
217 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  30.23 
 
 
224 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  30 
 
 
192 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
223 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
224 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  34.04 
 
 
221 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  30 
 
 
192 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
223 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  31.25 
 
 
183 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
223 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  30.23 
 
 
223 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
223 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  29.93 
 
 
391 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  33.59 
 
 
196 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  28.68 
 
 
234 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  31.54 
 
 
193 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  28.68 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  28.68 
 
 
234 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  28.68 
 
 
234 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  29.46 
 
 
221 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  28.68 
 
 
234 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  28.68 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  28.68 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  28.68 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  29.46 
 
 
221 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  31.54 
 
 
205 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  29.46 
 
 
223 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  26.72 
 
 
231 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  28.68 
 
 
207 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  28.47 
 
 
187 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  31.01 
 
 
303 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  25.93 
 
 
208 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
168 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  27.91 
 
 
207 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  30.23 
 
 
228 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  29.77 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  28.47 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  32.84 
 
 
203 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  29.23 
 
 
226 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  28.68 
 
 
450 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  27.54 
 
 
217 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  29.46 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  30.66 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  29.46 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  28.47 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  28.36 
 
 
274 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  29.85 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  29.85 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  29.1 
 
 
214 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  30.5 
 
 
424 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  28.24 
 
 
215 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  29.85 
 
 
212 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  28.47 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  29.46 
 
 
230 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  28.47 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  29.46 
 
 
198 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  31.78 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  28.91 
 
 
454 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  27.13 
 
 
220 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  28.24 
 
 
215 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  28.8 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  26.77 
 
 
265 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  29.46 
 
 
226 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  32.8 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  31.65 
 
 
279 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  29.2 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  27.56 
 
 
208 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  31.45 
 
 
150 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  28.17 
 
 
258 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  26.95 
 
 
207 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  29.29 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  23.85 
 
 
188 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  28.8 
 
 
183 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  27.01 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  27.2 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  24.44 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  32.26 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  28.46 
 
 
173 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  28.15 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  29.46 
 
 
302 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  30 
 
 
242 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  26.67 
 
 
246 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  25 
 
 
246 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  30 
 
 
257 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  26.23 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  26.92 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  31.75 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>