104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1471 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  607  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00493509  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  31.43 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.53 
 
 		 615 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.48 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.9 
 
 		 1081 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.41 
 
 		 444 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 442 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  32.64 
 
 		 567 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.06 
 
 		 446 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.06 
 
 		 446 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.52 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.56 
 
 		 446 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 446 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  30.07 
 
 		 442 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  28.33 
 
 		 1062 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.4 
 
 		 461 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0307  hypothetical protein  28.02 
 
 		 434 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.200326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.05 
 
 		 450 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.92 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  22.92 
 
 		 656 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.26 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 441 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.61 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  26.63 
 
 		 445 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.11 
 
 		 660 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  26.75 
 
 		 432 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  22.92 
 
 		 656 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  27.36 
 
 		 444 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 442 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  27.36 
 
 		 444 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  28.33 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.91 
 
 		 572 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  29.71 
 
 		 1079 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  34.19 
 
 		 1028 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  28.78 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.9 
 
 		 1066 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.36 
 
 		 445 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.12 
 
 		 1069 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.71 
 
 		 446 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1447  WD40 domain protein beta Propeller  28.36 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000967065  normal  0.55523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 		 701 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.03 
 
 		 438 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  28.33 
 
 		 1062 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.16 
 
 		 450 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  34.15 
 
 		 1059 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  28.77 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 449 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  25.44 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  27.78 
 
 		 1062 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  30.82 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  29.92 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.07 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.71 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  22.9 
 
 		 1062 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.11 
 
 		 1062 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.43 
 
 		 1067 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.86 
 
 		 441 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  28.8 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  28.77 
 
 		 439 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.25 
 
 		 1363 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  29.36 
 
 		 635 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 443 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 421 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  37.31 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  31.69 
 
 		 629 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.51 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.4 
 
 		 1065 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.5 
 
 		 428 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 446 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  22.27 
 
 		 1062 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  22.27 
 
 		 1062 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  24.02 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.73 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.13 
 
 		 428 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  29.37 
 
 		 441 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.73 
 
 		 430 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  34.06 
 
 		 1042 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  40.74 
 
 		 618 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1042 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.97 
 
 		 677 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  34 
 
 		 421 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  27.46 
 
 		 440 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  27.46 
 
 		 437 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  24.18 
 
 		 1060 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 441 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  28.33 
 
 		 445 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>