100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0420 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0420  regulatory protein TetR  100 
 
 		 188 aa  363  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.15036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  37.72 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.68 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4137  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  32.45 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  30.68 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 259 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 223 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 227 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  28.73 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  27.57 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  26.55 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  28.19 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 173 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  28.5 
 
 		 197 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  27.54 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 204 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 189 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  31.89 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  34.48 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>