256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06060 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND06060  histone deacetylation-related protein, putative  100 
 
 
763 aa  1563    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.34 
 
 
618 aa  146  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  32.82 
 
 
516 aa  130  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
1831 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 
696 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 
1163 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.67 
 
 
1652 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.49 
 
 
1364 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.13 
 
 
947 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.23 
 
 
742 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.1 
 
 
1443 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.59 
 
 
1217 aa  82  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.58 
 
 
1474 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.09 
 
 
1363 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.58 
 
 
1760 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  29.41 
 
 
790 aa  79.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.15 
 
 
1267 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.55 
 
 
930 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.65 
 
 
1214 aa  78.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.04 
 
 
740 aa  77  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 
1807 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.61 
 
 
1188 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.52 
 
 
1552 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 
1190 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.07 
 
 
1766 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 
1686 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.73 
 
 
1714 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.93 
 
 
1711 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.51 
 
 
1076 aa  75.1  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  29.68 
 
 
1100 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 
1878 aa  74.3  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.87 
 
 
1858 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.51 
 
 
1072 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.05 
 
 
1072 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.15 
 
 
1416 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.89 
 
 
1236 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.7 
 
 
1196 aa  71.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 
1661 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.85 
 
 
630 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.71 
 
 
1477 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.24 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.2 
 
 
1357 aa  69.3  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.06 
 
 
1213 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.21 
 
 
1221 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.78 
 
 
1553 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.19 
 
 
1208 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  28.71 
 
 
1152 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.67 
 
 
1626 aa  67.8  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.68 
 
 
1623 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.25 
 
 
1523 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.28 
 
 
1598 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.61 
 
 
675 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  24.33 
 
 
1264 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.87 
 
 
919 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.94 
 
 
1557 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 
1209 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  24.33 
 
 
1264 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.3 
 
 
1039 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.07 
 
 
1193 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.22 
 
 
664 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.62 
 
 
344 aa  64.7  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.69 
 
 
1398 aa  64.7  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.24 
 
 
1190 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.56 
 
 
1247 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 
1161 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 
1161 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.91 
 
 
792 aa  64.3  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.13 
 
 
1164 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.89 
 
 
1901 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.35 
 
 
434 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 
344 aa  63.9  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 
1304 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 
1789 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 
1411 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  25.85 
 
 
878 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.53 
 
 
1454 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.98 
 
 
1599 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 
1481 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.36 
 
 
657 aa  62  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.24 
 
 
1547 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.01 
 
 
1330 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  31.02 
 
 
652 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  29.73 
 
 
316 aa  61.6  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.91 
 
 
676 aa  61.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.52 
 
 
865 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.17 
 
 
1510 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  27.36 
 
 
881 aa  60.8  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.64 
 
 
1684 aa  60.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.27 
 
 
1177 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.81 
 
 
1211 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.68 
 
 
1188 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  27.75 
 
 
1157 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.3 
 
 
505 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.9 
 
 
565 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  28.32 
 
 
1373 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
1348 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.7 
 
 
1262 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
576 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.04 
 
 
1016 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  32.52 
 
 
1424 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>