More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1260 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1260  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.43 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.54 
 
 		 485 aa  65.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  35.81 
 
 		 855 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.52 
 
 		 364 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  30.71 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  32.24 
 
 		 503 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  30.71 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  32.39 
 
 		 505 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  31.58 
 
 		 503 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  27.86 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  28.8 
 
 		 520 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  28.18 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  33.57 
 
 		 501 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  32.24 
 
 		 461 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  33.12 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  29.73 
 
 		 520 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  27.14 
 
 		 412 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  31.16 
 
 		 500 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  31.16 
 
 		 498 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  28.26 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  31.16 
 
 		 490 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  30.57 
 
 		 484 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  31.16 
 
 		 498 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  31.16 
 
 		 498 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.18 
 
 		 507 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  32.17 
 
 		 498 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  29.66 
 
 		 474 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.06 
 
 		 432 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  25.89 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  31.16 
 
 		 499 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  31.16 
 
 		 499 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  26.58 
 
 		 505 aa  53.5  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  27.89 
 
 		 406 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  27.95 
 
 		 509 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 589 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  27.03 
 
 		 517 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.45 
 
 		 399 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  29.58 
 
 		 493 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  31.39 
 
 		 495 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  28.92 
 
 		 377 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  26.79 
 
 		 464 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  29.71 
 
 		 474 aa  52.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  29.58 
 
 		 490 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  29.58 
 
 		 476 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  29.87 
 
 		 513 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  29.87 
 
 		 513 aa  52  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  30.2 
 
 		 505 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  29.49 
 
 		 509 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  29.41 
 
 		 491 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  30.43 
 
 		 507 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  27.14 
 
 		 373 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  28.87 
 
 		 498 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  30.28 
 
 		 483 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0384  trypsin-like serine protease  27.42 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368801  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  28.39 
 
 		 467 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  29.7 
 
 		 508 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.95 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.1 
 
 		 375 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  29.71 
 
 		 502 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  29.71 
 
 		 502 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  29.71 
 
 		 461 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  25.48 
 
 		 402 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  31.29 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  28.71 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  29.71 
 
 		 502 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  29.71 
 
 		 485 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  29.29 
 
 		 482 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  26.09 
 
 		 402 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  29.71 
 
 		 502 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  29.71 
 
 		 485 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  29.71 
 
 		 502 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  30.46 
 
 		 528 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  30.07 
 
 		 409 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  28.1 
 
 		 493 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  25.48 
 
 		 402 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  29.3 
 
 		 477 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  29.3 
 
 		 477 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  28.99 
 
 		 487 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  30.43 
 
 		 488 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  29.3 
 
 		 526 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  28.22 
 
 		 492 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  31.17 
 
 		 481 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  23.29 
 
 		 466 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  31.25 
 
 		 492 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  26.13 
 
 		 377 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  27.22 
 
 		 397 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.3 
 
 		 423 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  31.25 
 
 		 479 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  25.52 
 
 		 497 aa  49.7  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  31.25 
 
 		 477 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  29.8 
 
 		 501 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.69 
 
 		 366 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>