More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1261 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 485 aa  974    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.38 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.23 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  34.47 
 
 		 855 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0628  hypothetical protein  25.68 
 
 		 289 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.19 
 
 		 585 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  25.42 
 
 		 593 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  29.81 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.05 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.96 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.56 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  33.33 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  31.33 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0384  trypsin-like serine protease  30.06 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368801  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  26.98 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  31.33 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  26.94 
 
 		 382 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  23.36 
 
 		 576 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1393  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241156 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1260  hypothetical protein  32.54 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  31.97 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  31.21 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  30.41 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.48 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2598  trypsin family protein  35.62 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  26.63 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  27.38 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.52 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  27.05 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  30.99 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  28.42 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  28.57 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  30.52 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  28.05 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  28.02 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.05 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  31.13 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  27.65 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  31.76 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  31.82 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  28.57 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  26.16 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.73 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  32.9 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  28.47 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.26 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  29.8 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  26.74 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  30.77 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.72 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  32.43 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  28.86 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.67 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  28.83 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  29.38 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  26.37 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.51 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  32.45 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  30.13 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  31.33 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.57 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  30.92 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  27.17 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  26.67 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  31.47 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  27.81 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.86 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  31.08 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  28.57 
 
 		 461 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  28.38 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  28.02 
 
 		 465 aa  57  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  29.58 
 
 		 497 aa  57  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  28.57 
 
 		 461 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  30.77 
 
 		 384 aa  57  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  28.93 
 
 		 478 aa  57  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  26.58 
 
 		 481 aa  57  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.11 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  30.52 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  27.52 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  32.03 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  29.86 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  29.87 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  32 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.93 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  29.22 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  27.1 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  29.86 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  27.57 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  28.57 
 
 		 524 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1646  serine protease, DO/DeqQ family  26.76 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  27.63 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  28.3 
 
 		 516 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  31.17 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  27.67 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  24.89 
 
 		 264 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>