25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1393 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  95.77 
 
 		 500 aa  692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1393  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 491 aa  926    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  84.63 
 
 		 484 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1737  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.16 
 
 		 466 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00165447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1102  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.58 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0401  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.2 
 
 		 487 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039914  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0088  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.77 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0039  hypothetical protein  30.59 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.304092  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0047  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0214  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0075  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.542735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.3 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.15 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.53 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 593 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  32.4 
 
 		 855 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  25.15 
 
 		 593 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  27.01 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.23 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  27.75 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>