More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3400 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  100 
 
 		 406 aa  830    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  72.66 
 
 		 406 aa  627  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 513 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.64 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  36.7 
 
 		 855 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.07 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  29.14 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.81 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  28.42 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  29.55 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0384  trypsin-like serine protease  30.77 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368801  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  32.89 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  30.99 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  28.83 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  28.83 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4353  serine endoprotease  28.89 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.139323  hitchhiker  0.00320689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.64 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  31.18 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0970  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  28.37 
 
 		 772 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  31.54 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  29.21 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  26.53 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  29.48 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.92 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  26.63 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  25.39 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  30.43 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  32.96 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  31.72 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  32.19 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  30.92 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  27.47 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  29.21 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  28.96 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.53 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  31.21 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.88 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  27.41 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  31.09 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  34.23 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  30.89 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  30.28 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.17 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  28.88 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1286  serine protease  28.32 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.72 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  29.14 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  28.92 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  29.03 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.64 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  27.44 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  28.34 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  30.37 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  29.75 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  33.33 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.28 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  31.1 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.09 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  25.36 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1719  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.76 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000748788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  25 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0754  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.73 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  30.63 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  26.39 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.82 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1938  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.62 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  30.28 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  24.44 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1069  serine protease, DegP/HtrA family  27.75 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.47 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  31.29 
 
 		 453 aa  57  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  31.82 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  26.27 
 
 		 471 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  29.26 
 
 		 451 aa  57  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.72 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.89 
 
 		 318 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  27.81 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.81 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  32.21 
 
 		 376 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.03 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.447417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  29.41 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.17 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0123278  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  29.26 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  29.82 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3072  putative serine protease protein  32.95 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  31.65 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  27.81 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  31.65 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  29.47 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>