More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1141 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1141  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.64 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  29.52 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  23.92 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  26.19 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  22.17 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  25.74 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  30.15 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  28.64 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.26 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  22.34 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
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NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  23.7 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  24.24 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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