113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1818 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
211 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  69.71 
 
 
210 aa  299  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.79 
 
 
213 aa  278  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  61.11 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.8 
 
 
219 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  58.14 
 
 
223 aa  242  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  56.62 
 
 
219 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.91 
 
 
218 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  50.7 
 
 
214 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  51.71 
 
 
216 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  51.71 
 
 
216 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  51.71 
 
 
216 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  50.47 
 
 
214 aa  185  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  48.15 
 
 
215 aa  184  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.69 
 
 
220 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.69 
 
 
220 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  47.69 
 
 
215 aa  177  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  46.48 
 
 
214 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.93 
 
 
220 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  47.93 
 
 
216 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  49.28 
 
 
214 aa  174  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  45.33 
 
 
215 aa  174  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  46.48 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.83 
 
 
214 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  46.58 
 
 
219 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.18 
 
 
219 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.44 
 
 
220 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  45.33 
 
 
230 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  45.33 
 
 
215 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  43.64 
 
 
221 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  46.84 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  46.19 
 
 
227 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.16 
 
 
213 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  53.99 
 
 
200 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.66 
 
 
218 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  42.25 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.76 
 
 
201 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.69 
 
 
214 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  44.24 
 
 
217 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.74 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.44 
 
 
370 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.38 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  37.25 
 
 
201 aa  111  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  34.4 
 
 
221 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  43.21 
 
 
190 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
206 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.03 
 
 
240 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.41 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.62 
 
 
206 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.36 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.35 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  32.42 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.11 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.54 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.37 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.02 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  35.14 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.71 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.58 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.46 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.47 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  27.64 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  34.31 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.36 
 
 
183 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  31.36 
 
 
180 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.85 
 
 
176 aa  48.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.63 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.05 
 
 
173 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  27.89 
 
 
180 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.83 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 
188 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.72 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  30.33 
 
 
193 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.84 
 
 
181 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.57 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
196 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  37.5 
 
 
175 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  33.04 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  33.8 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  29.49 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  34.15 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.47 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  40.58 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  28.69 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  34.78 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>