124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1817 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  42.71 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.42 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.96 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.42 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.62 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  33.5 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 		 220 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  35.56 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  32.83 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  36.84 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.4 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  34.95 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.79 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  35.45 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  32.79 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  33.66 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  31.87 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.64 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  32.6 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.18 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.66 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  32.34 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  30.56 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  31.15 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  32.26 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  33.49 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  31.32 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  31 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  32.4 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.56 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.94 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  28.04 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  28.64 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.73 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  33.12 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.71 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.17 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  26.79 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.11 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.22 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  29.63 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.41 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  37.86 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  27.18 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  28.02 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  28.02 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  28.02 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  28.21 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  26.56 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  35.35 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  21.84 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25.53 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.27 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.29 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.04 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  29.19 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.57 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.65 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.74 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  26.47 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.29 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.64 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.18 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>