124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6643 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  70.23 
 
 		 219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  68.95 
 
 		 219 aa  294  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.92 
 
 		 218 aa  293  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  67.44 
 
 		 223 aa  288  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.97 
 
 		 213 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  60.56 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.11 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  59.22 
 
 		 214 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  56.87 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.47 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  56.16 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  56.16 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  56.16 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.56 
 
 		 220 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.56 
 
 		 220 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  50.7 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  54.98 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.6 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  51.16 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  52.8 
 
 		 215 aa  217  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 		 220 aa  217  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  48.83 
 
 		 215 aa  216  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  50.46 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  47.89 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  51.87 
 
 		 214 aa  211  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  52.83 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.89 
 
 		 213 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  54.17 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  50.24 
 
 		 230 aa  207  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  48.13 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  48.42 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.89 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  50.23 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.69 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  50.92 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  61.49 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  48.87 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.72 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.86 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.54 
 
 		 370 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  50.31 
 
 		 190 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.41 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.39 
 
 		 199 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  44.92 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.39 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.35 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  35.43 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.55 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.36 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.9 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.71 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.32 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.94 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.93 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  32.65 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  42.25 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.23 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30 
 
 		 176 aa  48.9  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.91 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.54 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.41 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.32 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.05 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 178 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.07 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  24.85 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  28.47 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.52 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.88 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>