122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4054 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
219 aa  440  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  93.18 
 
 
220 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  91.78 
 
 
221 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  76.47 
 
 
227 aa  334  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.58 
 
 
220 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.58 
 
 
220 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  69.41 
 
 
215 aa  307  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  63.93 
 
 
220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  64.38 
 
 
215 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  62.56 
 
 
215 aa  288  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  61.19 
 
 
215 aa  287  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  64.38 
 
 
214 aa  286  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  63.47 
 
 
214 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.36 
 
 
213 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  58.45 
 
 
213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.56 
 
 
218 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.27 
 
 
213 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  58.9 
 
 
210 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  59.28 
 
 
217 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  51.6 
 
 
217 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.87 
 
 
219 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.77 
 
 
219 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  48.4 
 
 
223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.95 
 
 
201 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.17 
 
 
214 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.78 
 
 
218 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  50.53 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  48.19 
 
 
214 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  47.87 
 
 
216 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  47.87 
 
 
216 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  47.87 
 
 
216 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.27 
 
 
210 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.18 
 
 
211 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  47.42 
 
 
215 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  47.39 
 
 
201 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.82 
 
 
213 aa  165  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  54.07 
 
 
190 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  45.29 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 
199 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.21 
 
 
214 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.04 
 
 
222 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  44.8 
 
 
219 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  40.87 
 
 
221 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  54.41 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.09 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.96 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  41.54 
 
 
230 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.87 
 
 
206 aa  128  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.64 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.5 
 
 
240 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.54 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
212 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.09 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.85 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.79 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  34.42 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.24 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.43 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.23 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.8 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  27.73 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  31.51 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  35 
 
 
193 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.48 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  30.56 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.93 
 
 
183 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
179 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  30.32 
 
 
194 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.08 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.4 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.85 
 
 
173 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  27.68 
 
 
183 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.66 
 
 
390 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.84 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  44.74 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.11 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  32.58 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.86 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.77 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  39.77 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.33 
 
 
188 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.44 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.83 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.5 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  28.89 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  34.83 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  33.08 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>