266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5956 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
189 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.57 
 
 
181 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  41.73 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.64 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.94 
 
 
209 aa  94.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
185 aa  90.9  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.8 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
180 aa  89  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
191 aa  88.6  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.88 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.12 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.02 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.11 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.88 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.95 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.22 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.53 
 
 
204 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.87 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  32.94 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  29.35 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  30.21 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.9 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  38.05 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
205 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.93 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  32.31 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.51 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  28.5 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.46 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.73 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.52 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.72 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.55 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  27.08 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.94 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.77 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.03 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.13 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.05 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  30.26 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  30.54 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.04 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.61 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.99 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.23 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  28.73 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  36.29 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  30.73 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.23 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  27.72 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.45 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.51 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
221 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
221 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>