281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1784 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.65 
 
 
188 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.02 
 
 
188 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.54 
 
 
191 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.64 
 
 
178 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
185 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
187 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.74 
 
 
178 aa  101  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.22 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.69 
 
 
176 aa  98.2  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.69 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.53 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.9 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.05 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  34.69 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  33.5 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.49 
 
 
204 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.31 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.16 
 
 
218 aa  89  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  31.72 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
181 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.69 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
182 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.69 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
177 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.26 
 
 
198 aa  84.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  33 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.73 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  30.17 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.02 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  32.8 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.05 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.28 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  29.44 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.51 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  30.2 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  27.37 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  31.84 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.71 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  32.56 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.16 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.9 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  31.74 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  29.73 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  28.43 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.53 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.65 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  29.02 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.04 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.23 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  32.16 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  28.25 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>