184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7858 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.02 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  31.19 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.84 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  31.28 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.46 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.63 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.14 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  35.53 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  32.16 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.38 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.66 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.04 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.29 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.18 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.28 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.39 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.94 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.05 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.74 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.98 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  32.09 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.79 
 
 
221 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.09 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.68 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  31.55 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  31.63 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.93 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  27.55 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  30.68 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  32.52 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2085  deaminase-reductase domain-containing protein  34.09 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.242441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.79 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.33 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.95 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.12 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  26.34 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.21 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.57 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.6 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.82 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.04 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.09 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  30.93 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  36.43 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  29.02 
 
 
186 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.52 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  27.94 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.98 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  32.76 
 
 
183 aa  61.6  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  27.33 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.24 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.84 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.57 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.93 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  27.84 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  34.72 
 
 
151 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.67 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.01 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.11 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.25 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.61 
 
 
185 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  25.81 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>