More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0824 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
199 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
188 aa  124  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  33.69 
 
 
178 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
188 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
188 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  31.63 
 
 
189 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
178 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.57 
 
 
188 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
188 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
176 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
188 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  32.28 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.92 
 
 
178 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  31.41 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.89 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
181 aa  92  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.32 
 
 
180 aa  91.3  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  27.81 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.69 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.3 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.06 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
208 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.1 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
185 aa  88.6  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.06 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
201 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 
185 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.6 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 
217 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  42.57 
 
 
116 aa  84.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.46 
 
 
180 aa  84.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  28.95 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.43 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.44 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  30.22 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.26 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.29 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.87 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  25.98 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.63 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.26 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.3 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  29.57 
 
 
172 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  31.38 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.35 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.65 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.42 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  24.72 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  26.73 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  28.49 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.8 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.9 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  24.27 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  26.6 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  24.62 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  25 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  28.86 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.42 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  24.64 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  26.34 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.49 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  27.57 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.09 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  26.9 
 
 
219 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>