209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2397 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  100 
 
 
116 aa  236  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  66.96 
 
 
192 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.57 
 
 
188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.07 
 
 
188 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  41.75 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
188 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.57 
 
 
194 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.2 
 
 
189 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.24 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  38.83 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  39.81 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.78 
 
 
183 aa  73.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.22 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.91 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  38.68 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  38.74 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  36.28 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.2 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.65 
 
 
183 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.71 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  38.18 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.19 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.54 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.51 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  35.09 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.62 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.09 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.35 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.89 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.53 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.18 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.37 
 
 
179 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  36.89 
 
 
181 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.04 
 
 
192 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.91 
 
 
188 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.03 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.98 
 
 
190 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
201 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.04 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
180 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  31.15 
 
 
176 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
185 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.68 
 
 
180 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.73 
 
 
182 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.53 
 
 
188 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.68 
 
 
182 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.01 
 
 
187 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.95 
 
 
183 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  29.46 
 
 
199 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.91 
 
 
208 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.46 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
193 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.28 
 
 
188 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  30.28 
 
 
188 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.53 
 
 
183 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
188 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
190 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  35.24 
 
 
198 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  31.25 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.2 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  30.19 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.4 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.02 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.73 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.95 
 
 
208 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.08 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.36 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  26.92 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
195 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.37 
 
 
181 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.73 
 
 
176 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.65 
 
 
224 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.67 
 
 
187 aa  53.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.07 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
201 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33 
 
 
188 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  32.38 
 
 
167 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.83 
 
 
179 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.25 
 
 
189 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  33.91 
 
 
192 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.09 
 
 
219 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 
177 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  25.47 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.67 
 
 
208 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.36 
 
 
187 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
187 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  32.04 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  33.01 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  29.46 
 
 
199 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  27.72 
 
 
200 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.36 
 
 
191 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>