201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4307 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  100 
 
 
167 aa  346  7e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  68.67 
 
 
188 aa  222  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  65.85 
 
 
188 aa  213  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.52 
 
 
181 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.14 
 
 
183 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 
177 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  45.03 
 
 
182 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.51 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  45.33 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  40.88 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  40.82 
 
 
181 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  39.02 
 
 
185 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.91 
 
 
183 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  39.46 
 
 
181 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  35.9 
 
 
182 aa  101  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  37.8 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.44 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.34 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  36.49 
 
 
178 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  40.85 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.41 
 
 
189 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  37.24 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
188 aa  90.9  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.5 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.62 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38 
 
 
204 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.3 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  34.21 
 
 
185 aa  87.8  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
199 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  38.67 
 
 
215 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.9 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.71 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.37 
 
 
199 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
190 aa  85.1  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  37.33 
 
 
204 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.24 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
187 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
204 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.18 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.42 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.74 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.03 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.03 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.91 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.92 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.97 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.97 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.97 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.48 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  29.81 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.37 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.76 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.24 
 
 
204 aa  70.5  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.68 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.99 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.87 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.79 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.2 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.76 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  31.61 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.64 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.54 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  28.76 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.81 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  33.1 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.95 
 
 
188 aa  60.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 
210 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.37 
 
 
209 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>