271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3362 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  70.43 
 
 
187 aa  255  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  70.97 
 
 
187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  69.89 
 
 
187 aa  248  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  61.54 
 
 
196 aa  236  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  65.05 
 
 
187 aa  226  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  63.98 
 
 
187 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  53.01 
 
 
188 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  53.01 
 
 
188 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
188 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
199 aa  189  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  68.49 
 
 
182 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  44.92 
 
 
190 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.11 
 
 
190 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  39.89 
 
 
189 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.76 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  41.38 
 
 
190 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
188 aa  121  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.17 
 
 
188 aa  120  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.46 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  38.22 
 
 
178 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.21 
 
 
188 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
185 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.87 
 
 
199 aa  104  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.7 
 
 
182 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
182 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  41.07 
 
 
176 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
192 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
187 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.98 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.87 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.88 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  29.35 
 
 
182 aa  94.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
178 aa  94.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
184 aa  94.4  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  32.6 
 
 
200 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  35.63 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.57 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
183 aa  92.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  35.45 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
208 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.49 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
184 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.49 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  32.63 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  29.68 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.41 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.87 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  28.88 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  31.77 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.82 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.92 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.82 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  35.68 
 
 
221 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.03 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  34.41 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.72 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  27.13 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.17 
 
 
209 aa  70.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  31.91 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  27.92 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.5 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>