263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3644 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  82.35 
 
 
187 aa  292  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.57 
 
 
188 aa  210  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.87 
 
 
187 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.87 
 
 
187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.34 
 
 
187 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  47.34 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.99 
 
 
190 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.48 
 
 
188 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  43.48 
 
 
188 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  43.48 
 
 
188 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.21 
 
 
187 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  41.62 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.38 
 
 
186 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  41.62 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  41.62 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.43 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.25 
 
 
185 aa  121  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.78 
 
 
191 aa  120  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  39.57 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.74 
 
 
199 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  52.17 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.24 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
186 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  38.76 
 
 
178 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
176 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  37.91 
 
 
183 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.46 
 
 
186 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.83 
 
 
184 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
176 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  33.71 
 
 
182 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
183 aa  101  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 
192 aa  100  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.58 
 
 
176 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
178 aa  98.2  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.62 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  37.27 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.79 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
188 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.21 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.2 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.27 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.07 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.9 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  33.67 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  30 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.83 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.66 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.96 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  33.17 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.81 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.83 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  25.67 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.35 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.15 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.05 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  26.11 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.53 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  31.02 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  30.98 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  25.81 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  25.81 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  25.81 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  25.13 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  31.09 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  28.72 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  24.06 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  25.27 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  26.96 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  28.72 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  23.73 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>