248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4109 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  86.84 
 
 		 195 aa  337  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  51.34 
 
 		 193 aa  197  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  52.94 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.15 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.53 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.47 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  51.05 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  46.6 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  49.49 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.42 
 
 		 191 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  46.84 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  46.32 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  46.7 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  43.39 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.98 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  50 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  37.76 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.74 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  32.64 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.55 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.86 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.6 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.11 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  36.41 
 
 		 175 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  30.53 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.76 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  34.25 
 
 		 173 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.61 
 
 		 173 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.67 
 
 		 174 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  33.87 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.65 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  30.17 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  31.77 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  33.16 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  30.17 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  30.17 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  29.61 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.98 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.16 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  29.61 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  29.78 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  33.16 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.98 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  28.86 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  31.02 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.97 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  31.77 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  29.7 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.27 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.18 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.5 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.95 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.59 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.43 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  28.79 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.84 
 
 		 177 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  34.54 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.73 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.61 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.04 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.2 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.03 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.13 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.41 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.13 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.88 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.86 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>